Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LitafQ9JLJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LitafQ9JLJ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LitafQ9JLJ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms