Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bace2Q9JL18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace2Q9JL18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.1 ms