Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem3Q9JKE1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms