Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp5Q9JKD3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms