Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alyref2Q9JJW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alyref2Q9JJW6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms