Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco4Q9JIS3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco4Q9JIS3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco4Q9JIS3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco4Q9JIS3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smco4Q9JIS3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco4Q9JIS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms