Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx21Q9JIK5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddx21Q9JIK5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms