Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Copb1Q9JIF7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms