Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Exosc9Q9JHI7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Exosc9Q9JHI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Exosc9Q9JHI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms