Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1Q9ESG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms