Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn3Q9ES97 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn3Q9ES97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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