Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ush1cQ9ES64 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms