Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp29Q9ES63 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp29Q9ES63 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms