Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim54Q9ERP3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim54Q9ERP3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
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