Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tfip11Q9ERA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms