Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Ndst4Q9EQW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Ndst4Q9EQW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Ndst4Q9EQW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Ndst4Q9EQW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst4Q9EQW8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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