Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp3a44Q9EQW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp3a44Q9EQW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms