Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndst3Q9EQH7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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