Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r172Q9EPS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r172Q9EPS4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r172Q9EPS4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r172Q9EPS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r172Q9EPS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r172Q9EPS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms