Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clstn1Q9EPL2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms