Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop7Q9DCH2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop7Q9DCH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop7Q9DCH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms