Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpne8Q9DC53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms