Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok3Q9DBU3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms