Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcg8Q9DBM0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcg8Q9DBM0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcg8Q9DBM0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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