Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med27Q9DB40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med27Q9DB40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med27Q9DB40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms