Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm2aQ9DAR1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm2aQ9DAR1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms