Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAA3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms