Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700018B08RikQ9DA83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700018B08RikQ9DA83 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms