Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ift43Q9DA69 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ift43Q9DA69 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms