Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco2Q9DA21 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smco2Q9DA21 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms