Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldnd2Q9D9H2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms