Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan13Q9D8C2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tspan13Q9D8C2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan13Q9D8C2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms