Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4bQ9D8B3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms