Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap3Q9D706 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap3Q9D706 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms