Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs8Q9D6Y4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs8Q9D6Y4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms