Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calml3Q9D6P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calml3Q9D6P8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calml3Q9D6P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms