Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lpcat2bQ9D5U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lpcat2bQ9D5U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms