Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn11Q9D572 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn11Q9D572 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms