Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930470P17RikQ9D542 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms