Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc7Q9D541 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc7Q9D541 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms