Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms