Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tomm20lQ9D4V6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tomm20lQ9D4V6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tomm20lQ9D4V6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms