Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc83Q9D4V3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc83Q9D4V3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms