Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms