Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf6Q9D4J7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms