Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sohlh2Q9D489 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sohlh2Q9D489 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms