Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy3Q9D394 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy3Q9D394 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms