Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf1Q9D2H9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaaf1Q9D2H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaaf1Q9D2H9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms