Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc6bQ9D289 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms