Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krtap5-3Q9D226 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krtap5-3Q9D226 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms